Galvenā laboratorija (70 m2) – tiek izmantota ūdens ķīmiskajām un mikrobu analīzēm;

Hidrauliskā laboratorija (70 m2) – tiek izmantota studentu apmācību procesā, tajā ir mācību aprīkojumi filtrācijai, koagulācijai un sedimentācijas procesiem, kā arī dzeramā ūdens sistēmas modelis;

Biotehnoloģiju laboratorija (vairāk kā 100 m2), kurā ir

1. atsevišķa klimata telpa ar regulējamu temperatūru un mitruma līmeni jutīgu iekārtu un procesu veikšanai;
2. atsevišķa mikrobioloģijas telpa darbam ar konkrētiem mikroorganismiem vai darbam mikroorganismu brīvā vidē;
3. anaerobā kamera darbam ar skābekļa jutīgiem mikroorganismiem.